Les projets financés
PandemicStop-AI
Découvrir rapidement de nouveaux antibiotiques grâce à la mise en œuvre d’une boucle d’apprentissage continu supportée par l’intelligence artificielle et la production de données à haut débit sur les molécules candidates.

Équipe et partenaires
Directeur scientifique

Dr Yves Brun
Université de Montréal

Jacques Corbeil
Université Laval et Mila
Équipe scientifique
- Anne Marinier – Université de Montréal et IRIC
- Dominique Beaini — Valence Labs, Université de Montréal et Mila
- Sarath Chandar — Polytechnique Montréal et Mila
- André Charette — Université de Montréal
- Audrey Durand — Université Laval et Mila
- Alex Hernandez-Garcia — Université de Montréal et Mila
- Flavie Lavoie-Cardinal — Université Laval et Mila
- Michal Koziarski — The Hospital for Sick Children / University of Toronto
- Dao Nguyen — McGill University
- Jian Tang — HEC Montréal et Mila
- Pierre Thibault — Université de Montréal
- Michael Tyers — University of Toronto / The Hospital for Sick Children
- Sébastien Lemieux — Université de Montréal et Mila
- David Wishart — University of Alberta
- Frédérique Le Roux — Université de Montréal
- Marilyse Duperthuis — Université de Montréal
- Soren Gantt — Université de Montréal
Institutions et partenaires clés

Au-delà de son consortium principal, PandemicStop-AI s'appuie sur un écosystème élargi de partenaires nationaux et internationaux qui renforce sa capacité d'innovation et accélère le transfert des découvertes vers des applications concrètes. Cet écosystème comprend notamment le McGill Antimicrobial Resistance Centre, l’initiative AMRQ, le réseau pan-canadien Can-AMR-Net, Médicament Québec, l'Institut Pasteur, le Fonds de recherche biomédicale du Canada (CBRF), le PPPeC et IVADO R3AI, qui contribuent à la collaboration scientifique, au partage des connaissances, au développement des talents et au rayonnement du projet.
Le consortium poursuit également l'expansion de ce réseau stratégique pour former un écosystème élargi à l’international incluant le consortium Gr-ADI, NCCR AntiResist, CO-ADD et Breakthrough, afin d'accélérer la découverte de nouveaux antibiotiques et de renforcer la préparation aux futures pandémies bactériennes.
Le défi adressé
La résistance aux antibiotiques est l'une des plus grandes menaces pour la santé mondiale. En 2019, elle a causé davantage de décès que la COVID-19 lors de ses deux premières années de pandémie.
Malgré cette urgence, très peu de nouvelles classes d'antibiotiques ont été découvertes au cours des dernières décennies. La découverte de nouveaux traitements demeure longue, coûteuse et complexe, alors que l'émergence de bactéries résistantes pourrait provoquer de futures pandémies.
Le Canada doit donc être capable de découvrir rapidement de nouveaux antibiotiques lorsqu'un nouveau pathogène apparaît dans notre environnement.
La solution
PandemicStop-AI développe une plateforme intégrée qui combine l'intelligence artificielle, les technologies de criblage à haut débit et l'expertise d'un vaste réseau de partenaires afin d'accélérer la découverte de nouvelles classes d'antibiotiques.
En exploitant d'importantes quantités de données expérimentales, la plateforme permet d'explorer beaucoup plus rapidement l'immense espace chimique des molécules potentielles, d'identifier les candidats les plus prometteurs et de les faire progresser vers les essais précliniques.
L'objectif est de doter le Canada d'une capacité de réponse rapide face aux futures épidémies d’origine bactérienne.

Le fonctionnement
1. Apprendre : Générer de vastes ensembles de données sur les interactions entre les bactéries et des millions de composés chimiques afin d'entraîner des modèles d'intelligence artificielle.
2. Découvrir : Utiliser l'intelligence artificielle et des plateformes de criblage automatisées pour identifier rapidement de nouveaux antibiotiques efficaces et sécuritaires.
3. Accélérer : Optimiser les meilleurs candidats, développer leur fabrication au Canada et les préparer pour les études précliniques et cliniques.
Impact attendu
PandemicStop-AI permettra :
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D’accélérer la découverte de nouvelles classes d'antibiotiques;
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De renforcer la capacité du Canada à répondre rapidement à l'émergence de bactéries résistantes;
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De réduire la dépendance envers les chaînes d'approvisionnement internationales pour les molécules critiques;
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De soutenir le développement d'une filière canadienne en intelligence artificielle appliquée à la découverte de médicaments;
-
De mieux protéger la population contre les futures épidémies d’origine bactérienne.


Effet levier
Le projet rassemble un écosystème pancanadien unique composé de partenaires académiques, publics et industriels, couvrant l'ensemble de la chaîne de découverte et de développement des antibiotiques.
En intégrant l'intelligence artificielle, les plateformes de criblage, la chimie médicinale et la fabrication, PandemicStop-AI crée une capacité durable qui accélérera également le développement de futurs projets collaboratifs et de nouvelles innovations thérapeutiques en chimie médicinale.
Les infrastructures mises en place
Une plateforme nationale de découverte accélérée d'antibiotiques qui comprend :
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Des modèles d'intelligence artificielle entraînés pour identifier de nouveaux candidats thérapeutiques;
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Des plateformes de criblage automatisées à haut débit capables d'analyser des milliers de composés par jour;
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Des technologies avancées d'imagerie cellulaire permettant de caractériser rapidement les mécanismes d'action des molécules;
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Des capacités de synthèse et de mise à l'échelle des candidats les plus prometteurs;
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Un réseau intégré reliant la découverte, le développement et la préparation aux essais pré-cliniques.

Où en est le projet ?
Développement et validation des plateformes de découverte accélérée d'antibiotiques
Jalons atteints
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Mise en place d'un consortium pancanadien réunissant les expertises en microbiologie, en intelligence artificielle, en chimie et en développement pharmaceutique.
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Développement de plateformes de criblage automatisées et de modèles d'intelligence artificielle.
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Identification de premiers candidats antibiotiques prometteurs grâce aux approches expérimentales et in silico.
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Validation de nouvelles molécules prototypes présentant une activité contre des bactéries résistantes.
Prochaines étapes
- Optimiser les modèles d'intelligence artificielle pour accélérer encore davantage la découverte de nouvelles molécules.
- Faire progresser les meilleurs candidats vers le développement préclinique.
- Déployer une plateforme prête à être adaptée rapidement lors de l'émergence d'un nouveau pathogène résistant.